Один из старейших подобных музеев в Волго-Вятском регионе. Начало ему положил в 1935 году зав. кафедрой естественных наук Марийского государственного педагогического института П.Г.Ефремов, открыв при кафедре биологический кабинет с небольшим количеством чучел животных. В 1938 г. кабинет получил статус музея. Часть экспонатов была закуплена, но большинство изготовил сам руководитель со своими учениками Н.С.Егошиным и Н.М.Мироновым, в 1950-60 гг. к этому приложили руки Х.Ф.Балдаев, Р.И.Гаврилов, позже к ним присоединился доцент И.И.Дробот - главный таксидермист музея того времени. А наиболее сложные экспонаты были изготовлены известными российскими мастерами С.Н.Коксиным, С.Н.Мазюхиным, В.В.Степановым.

В 1972 г. музей вместе с факультетом естествознания был передан только что образованному Марийскому государственному университету. В новых условиях музей продолжал развиваться еще более быстрыми темпами. Большой вклад в его развитие внес доктор биологических наук профессор Л.Н.Вейцман, который приобрел редчайшие экспонаты морской и океанической фауны.

Сейчас музей занимает три зала корпуса "Б" МарГУ, выставлено более тысячи экспонатов, что приблизительно составляет 680 видов беспозвоночных и позвоночных животных. В 2000 году при музее открыта таксидермическая мастерская. Создан фонд чучел для обмена с другими музеями. В год проводится примерно 100 - 120 экскурсий.

Фото первой половины 1970-х гг. Автор неизвестен.